Min erfaring som vitenskapelig assistent: Isolering av sjøørret-DNA

Dette semesteret har jeg fått muligheten til å være vitenskapelig assistent i et forskningsprosjekt om migrasjonsadferd hos sjøørret (Salmo trutta), med fokus på kjønnsbestemmelse. Formålet med prosjektet er å få innsikt i kjønnsspesifikke migrasjonsmønstre, det vil si forskjellene mellom individer som blir værende i ferskvann og de som vandrer ut i sjøen, og hvordan det varierer mellom kjønnene. Prøvene er tatt i to bekker: Kvernbekken i Kristiansand og Steindalsbekken i Lillesand. Dette er en del av et større prosjekt som undersøker migrasjonsvalg hos unge laksefisk.

Min rolle har vært å utføre laboratoriearbeid, spesifikt isolering av sjøørret-DNA. Prøvene som er samlet inn er vevsprøver fra gattfinnen til individene, og jeg har bearbeidet deler av disse prøvene videre. For å isolere DNA-et har jeg benyttet E.Z.N.A Tissue DNA kit (Omega Bio-Tek), hvor prosessen kan oppsummeres i tre hovedtrinn. Prøvene blir først utsatt for lysering, det vil si at cellemembranen brytes ned slik at man tilgjengeliggjør DNA. Deretter tilsetter man en rekke buffere/enzymer som bryter ned proteiner og celler videre, samt vaskebuffere for å rense prøvene. Til slutt feller man ut DNA gjennom en prosess kalt eluering, og prøvene er dermed klare til videre analyser. I tillegg har jeg målt DNA-konsentrasjonen ved hjelp av spektrofotometri.

Dette prosjektet har gitt meg verdifull erfaring innenfor laboratoriearbeid og molekylærbiologi. Jeg er veldig takknemlig for at jeg fikk bidra til dette forskningsprosjektet, det har vært spennende og gøy. Tusen takk til Lars Mørch Korslund for at jeg fikk denne muligheten, og tusen takk til Baver Dehghan for god opplæring. Jeg vil også takke Universitet i Agder og «Studenter i forskning»-programmet for støtten 🙂